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<title><string language="fre"><![CDATA[Charline HERRSCHER, Sébastien EYMIEUX & Christophe HOURIOUX - Mise au point d'un test rapide d'évaluation et de caractérisation de la réponse immune spécifiquement dirigée contre le SARS-CoV-2 » (Projet SeroCov)]]></string></title>
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<string language="fre"><![CDATA[Ce projet soutenu par l’ANR et la région, propose d’étudier
les caractéristiques de la réponse immunitaire, qu’elle soit générée après un
épisode infectieux ou après la vaccination. De nombreux outils de biologie
moléculaire ont été rapidement mis au point depuis le début de l’épidémie, à la
fois pour le diagnostic de la maladie, mais aussi pour la détermination du
statut sérologique du patient et ainsi identifier les personnes vaccinées ou
ayant été en contact avec le SARS-CoV-2. Toutefois, ces outils ne permettent
pas d’étudier la réponse anticorps de façon étendue, par exemple de déterminer
ses caractéristiques précises au regard de la sévérité de la maladie, de l’âge
des patients, ou de facteurs de comorbidité associés.
 Ainsi pour étudier la qualité de la réponse humorale, les
protéines structurales du virus, dont la protéine S dite « spike »,
ainsi que la protéine de nucléocapside, ont été cartographiées par différents
outils de prédiction et d’analyses bio-informatiques (immunogénicité,
positionnement dans la structure tridimensionnelle, comparaisons de séquences).
Cette analyse in silico a permis d’identifier des épitopes B linéaires, qui ont
été synthétisés sous forme de peptides. La réactivité de ces peptides
synthétiques a ensuite été évaluée vis à vis de sérums de patients ayant été
infectés par le SARS-CoV-2 (RT-PCR sur écouvillon nasal positive). Par ailleurs,
pour accroitre la spécificité des tests, des peptides « contrôles »
de nucléocapside ont été utilisés pour préciser le statut immunitaire des
patients vis-à-vis des coronavirus bénins (HcoV) circulant habituellement. De
façon similaire, des peptides dirigés contre NS8, une protéine exclusivement
codée par le virus SARS-CoV-2 et absente chez les autres coronaviridae,
ont également été introduits.
 Les premiers résultats présentés dans ce travail restent
préliminaires. Ils montrent que la détermination de profils de réactivité
contre les peptides couvrant la protéine S comporte de nombreux obstacles. Il
est ainsi difficile d’établir des cartographies de réponses anti-S pouvant être
corrélée à des facteurs individuels comme la sévérité clinique de la COVID
observée chez les patients hospitalisés.
En revanche, la réponse dirigée contre la nucléocapside est
plus constante, et surtout plus facilement détectée par nos tests.  Des analyses statistiques sont actuellement
en cours pour la détermination de profils de réactivité.
 L’ensemble de ces travaux pourraient générer des outils
d’investigation de la réponse immunitaire, dans des applications de suivi
épidémiologique au cours du temps notamment pour caractériser l’immunité de
groupe et sa persistance au sein des populations  vaccinées ou immunisées par infection
naturelle.  La cartographie des épitopes
réactifs sur le plan antigénique pourrait également contribuer à l’évaluation
des stratégies vaccinales futures, notamment dans le contexte de l’émergence de
nouveaux variants du SARS-CoV-2.]]></string></description>
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@LE STUDIUM 2021]]></string>
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