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Quelques éléments à propos de la thérapie génique. (Bioinformatique)
Description
:
L’auteur propose un cours sur la thérapie génique. Après avoir défini le sujet, il aborde les erreurs de métabolisme des mitochondries dans les maladies génétiques. Il poursuit avec un exemple de produit de thérapie génique pour la myopathie de Duchenne. Enfin, un tableau récapitule les ...
Mots clés
:
thérapie génique, maladie héréditaire, mitochondrie, gène, chromosome, bio-informatique, bioinformatique
Date
:
12-11-2007
Droits
:
Cette ressource est accessible à tous sous un contrat Creative Commons (Paternité-Pas d'utilisation commerciale- Pas de modification) http://creativecommons.org/licences/by-nc-nd/2.0/fr/.
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Les matrices de substitution. (Bioinformatique)
Description
:
L’auteur de la ressource présente les matrices nucléiques et protéiques : PAM ("Point Accepted Mutation"), BLOSUM ("BLOcks SUbstitution Matrix"), Gonnet. Il propose aussi quelques pistes pour choisir la matrice protéique, ainsi que des références bibliographiques.
Mots clés
:
acide nucléique, acide aminé, Henikoff, matrice, protéine, bio-informatique
Date
:
29-01-2010
Droits
:
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Les matrices de substitution. (Bioinformatique)
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Algorithmes et programmes de comparaison de séquences : Interprétation des résultats : E-value, P-value. (Bioinformatique)
Description
:
Présentation de l’algorithme de Needleman & Wunsch et de l’algorithme de Smith & Waterman. L’auteur aborde également les programmes FASTA, BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) et le programme Clustal W. Pour terminer, il traite du modèle de Markov caché et de l’interprétation des ...
Mots clés
:
algorithme génétique, Needleman, Wunsch, Smith, Waterman, bio-informatique, logiciel
Date
:
24-03-2010
Droits
:
Cette ressource est accessible à tous sous un contrat Creative Commons (Paternité-Pas d'utilisation commerciale- Pas de modification) http://creativecommons.org/licences/by-nc-nd/2.0/fr/.
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Algorithmes et programmes de comparaison de séquences : Interprétation des résultats : E-value, P-value. (Bioinformatique)
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La bioinformation : Molécules support, types et obtention. (Bioinformatique)
Description
:
L’auteur présente la notion de bioinformation. Il aborde les deux types de molécules support de la bioinformation : les acides nucléiques (ADN, ARN) et les protéines, les deux types de bioinformation : la séquence des nucléotides et la séquence des acides aminés et l'obtention des sé ...
Mots clés
:
bio-informatique, acide nucléique, ADN, ARN, protéine, nucléotide, molécule
Date
:
17-09-2006
Droits
:
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La bioinformatique : Définition, description, démarche et principales étapes.
Description
:
L’auteur propose une introduction à la bioinformatique. Il décrit cette discipline, explique la démarche de celle-ci, fait un rappel historique sur les principales étapes en biologie moléculaire et en informatique. Il aborde aussi des domaines d’étude en « ome » ou « omique ». Des ré ...
Mots clés
:
bio-informatique, banque de données, biomolécule, molécule
Date
:
02-02-2009
Droits
:
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Le stockage de la bioinformation : Les banques de données. (Bioinformatique)
Description
:
L'auteur de la ressource propose une liste de banque de données généralistes ou spécialisées dans l'information biologique. Des références bibliographiques complètent le cours.
Mots clés
:
bio-informatique, information biologique, banque de données
Date
:
17-09-2008
Droits
:
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Analyser les génomes des océans
Description
:
Grâce aux techniques de séquençage de l’ADN, nous avons aujourd’hui les moyens technologiques de connaitre le génome des organismes vivants, le plancton des océans y compris. Mais est-ce si simple ? Comment extraire de l’information biologique de gigantesques masses de données contenant des fragments ...
Mots clés
:
séquençage ADN, bioinformatique, extraction information, génome, algorithme
Date
:
05-09-2019
Droits
:
Ce document est diffusé sous licence Creative Commons : Paternité - Pas d'utilisation commerciale - Pas de modification. http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.0/fr/legalcode
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Analyser les génomes des océans
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Algorithmes et génomes : analyse informatique de l'information génétique : 1ere partie
Description
:
La séquence de caractères est un des objets que les informaticiens connaissent bien et pour lequel ils ont développé de très nombreux algorithmes. C’est donc très naturellement que l’informatique et les sciences du vivant se sont rencontrées autour de la problématique de l’analyse des séquences ...
Mots clés
:
algorithme, bioinformatique, analyse de génome, séquence génomique
Date
:
23-11-2011
Droits
:
Droits réservés à l'éditeur et aux auteurs.
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Algorithmes et génomes : analyse informatique de l'information génétique : 1ere partie
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Algorithmes et génomes : analyse informatique de l'information génétique : 2ème partie
Description
:
La séquence de caractères est un des objets que les informaticiens connaissent bien et pour lequel ils ont développé de très nombreux algorithmes. C’est donc très naturellement que l’informatique et les sciences du vivant se sont rencontrées autour de la problématique de l’analyse des séquences ...
Mots clés
:
algorithme, bioinformatique, analyse de génome, séquence génomique
Date
:
23-11-2011
Droits
:
Droits réservés à l'éditeur et aux auteurs.
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Algorithmes et génomes : analyse informatique de l'information génétique : 2ème partie
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L’informatique dans les sciences de la vie
Description
:
Dans cet exposé François Rechenmann propose un rapide survol des méthodes algorithmiques utilisées au niveau de l'analyse du génome. On y découvre que l'informatique est à la fois un outil incontournable, puisque seules des méthodes algorithmiques automatiques issus de travaux sur le traitement ...
Mots clés
:
biologie, dynamique des populations, bioinformatique, alignement de séquences, analyse statistique, système dynamique, phylogénétique, représentation des données, algorithmique, simulation, génome, évolution, région codante
Date
:
10-06-2009
Droits
:
Droits réservés à l'éditeur et aux auteurs.
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L’informatique dans les sciences de la vie
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