344 résultats : modélisation

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Canal-U
1.7. Promenade sur l’ADN
Description : Quand les biologistes se sont trouvés confrontés au premier texte génomique, dans la deuxième moitié des années 70, ils ont été quelque peu désemparés. On peut le comprendre. Encore une fois, regardez une petite portion d'un texte de génome bactérien ici. Suite de lettres - C, G, et cetera. - pas ...
Mots clés : ADN, génomique, algorithmique, bioinformatique, biologie cellulaire et moléculaire, modélisation
Date : 01-06-2015
Droits : Droits réservés à l'éditeur et aux auteurs. Ces ressources de cours sont, sauf mention contraire, diffusées sous Licence Creative Commons. L’utilisateur doit mentionner le nom de l’auteur, il peut exploiter l’œuvre sauf dans un contexte commercial et il ne peut apporter de modifications à l’œuvre ...
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1.7. Promenade sur l’ADN
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Canal-U
1.9. Prédire l’origine de réplication
Description : Nous avons écrit un algorithme sympathique en ce qu'il dessine un chemin conforme à la succession des lettres d'une séquence génomique. Cet algorithme simple, au-delà du dessin qu'il produit, est-il susceptible de produire des résultats interprétables par un biologiste ? La réponse est oui. Nous ...
Mots clés : génomique, algorithmique, bioinformatique, biologie cellulaire et moléculaire, modélisation
Date : 01-06-2015
Droits : Droits réservés à l'éditeur et aux auteurs. Ces ressources de cours sont, sauf mention contraire, diffusées sous Licence Creative Commons. L’utilisateur doit mentionner le nom de l’auteur, il peut exploiter l’œuvre sauf dans un contexte commercial et il ne peut apporter de modifications à l’œuvre ...
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1.9. Prédire l’origine de réplication
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Canal-U
1.10. Des fenêtres glissantes et recouvrantes
Description : Notre sympathique algorithme de balade sur l'ADN, a permis de mettre en évidence des biais de composition de séquences, a fait apparaître sur le tracé un point de rebroussement que l'on peut interpréter comme étant l'origine de réplication. On peut donc être fier d'avoir un algorithme qui serait ...
Mots clés : génomique, algorithmique, bioinformatique, biologie cellulaire et moléculaire, modélisation
Date : 01-06-2015
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1.10. Des fenêtres glissantes et recouvrantes
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Canal-U
2.1. La séquence est-elle un bon modèle de l’ADN ?
Description : L'ADN porte l'information génétique, plus précisément l'ADN porte les gènes, c'est-à-dire les régions de cette molécule qui portent l'information utilisée par la cellule pour synthétiser les protéines. Durant cette partie, nous allons nous intéresser plus particulièrement aux gènes et aux protéines ...
Mots clés : ADN, génomique, algorithmique, bioinformatique, biologie cellulaire et moléculaire, modélisation
Date : 01-06-2015
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2.1. La séquence est-elle un bon modèle de l’ADN ?
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Canal-U
2.2. Les gènes, de Mendel à la biologie moléculaire
Description : La séquence de caractères est un bon modèle de l'ADN, un des modèles possibles de l'ADN et il est bon parce qu'il est utile. On va voir en particulier que ce modèle simple peut servir de support à de la prédiction de gènes. On va pouvoir grâce à ce modèle-là, avec les algorithmes appropriés, trouver ...
Mots clés : ADN, génomique, algorithmique, bioinformatique, biologie cellulaire et moléculaire, modélisation
Date : 01-06-2015
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2.2. Les gènes, de Mendel à la biologie moléculaire
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Canal-U
2.6. Algorithmes + structures de données = programmes
Description : En écrivant le code de la fonction, qui recherche un triplet dans le tableau qui implémente le code génétique, nous avons terminé et obtenu un algorithme de traduction d'une séquence d'ADN, voire d'ARN, en protéines. Arrêtons-nous quelques instants pour évaluer la qualité de cet algorithme, et en ...
Mots clés : génomique, algorithmique, bioinformatique, biologie cellulaire et moléculaire, modélisation
Date : 01-06-2015
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Canal-U
2.9. Le séquençage de génomes complets
Description : Les progrès dans les technologies de séquençage ont permis d'aborder le séquençage complet de génome. Là encore, les progrès ont été spectaculaires. Prenons l'exemple du projet de séquençage de la bactérie Bacillus subtilis. A l'époque, ce projet s'est étalé de 1989 à 1998. Il a impliqué 35 labo ...
Mots clés : ADN, génomique, algorithmique, bioinformatique, biologie cellulaire et moléculaire, modélisation
Date : 01-06-2015
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2.9. Le séquençage de génomes complets
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Canal-U
2.3. Le code génétique
Description : Gènes et protéines, mais qu'est-ce qu'une protéine ? Une protéine, c'est également une molécule qui est constituée d'une succession de ce que l'on appelle les acides aminés. C'est donc une chaîne d'acides aminés qui sont des motifs chimiques élémentaires. Il existe 20 acides aminés distincts. Chacun ...
Mots clés : ADN, génomique, algorithmique, bioinformatique, biologie cellulaire et moléculaire, modélisation
Date : 01-06-2015
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2.3. Le code génétique
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Canal-U
2.4. Un algorithme de traduction
Description : Une protéine, en tant que succession d'acides aminés, peut-être vue comme le résultat d'un processus de traduction d'une chaîne de caractères écrite dans un alphabet de 4 lettres en une autre chaîne de caractères écrite en un l'alphabet de 20 lettres. La correspondance entre ces 2 chaînes, la table ...
Mots clés : génomique, algorithmique, bioinformatique, biologie cellulaire et moléculaire, modélisation
Date : 01-06-2015
Droits : Droits réservés à l'éditeur et aux auteurs. Ces ressources de cours sont, sauf mention contraire, diffusées sous Licence Creative Commons. L’utilisateur doit mentionner le nom de l’auteur, il peut exploiter l’œuvre sauf dans un contexte commercial et il ne peut apporter de modifications à l’œuvre ...
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2.4. Un algorithme de traduction
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Canal-U
2.5. Implémenter le code génétique
Description : Nous avons écrit le corps de l'algorithme de traduction, et nous avons fractionné la complexité d'écriture de cet algorithme en faisant appel à une fonction qui recherche dans le tableau, qui représente le code génétique, un triplet donné et renvoie l'acide aminé. Nous avons donc obtenu cette première ...
Mots clés : ADN, génomique, algorithmique, bioinformatique, biologie cellulaire et moléculaire, modélisation
Date : 01-06-2015
Droits : Droits réservés à l'éditeur et aux auteurs. Ces ressources de cours sont, sauf mention contraire, diffusées sous Licence Creative Commons. L’utilisateur doit mentionner le nom de l’auteur, il peut exploiter l’œuvre sauf dans un contexte commercial et il ne peut apporter de modifications à l’œuvre ...
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2.5. Implémenter le code génétique
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