17 résultats : phylogénétique

Symbiologik : jouez avec les gènes

Symbiologik : jouez avec les gènes

Description : Ce jeu vous propose d’expérimenter trois tâches parmi les plus courantes en bioinformatique : l’assemblage de fragments d’ADN, la recherche de motifs communs à plusieurs protéines, la construction d’arbres phylogénétiques.

Mots clés : jeu, ADN, recherche de motifs, arbre phylogénétique, séquençage du génome, fuscia

Date : 06-12-2005

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Faire l’inventaire du vivant : informatique et systématique

Faire l’inventaire du vivant : informatique et systématique

Description : 2010 est l’année internationale de la biodiversité, c’est l’occasion de faire le point sur ce thème et ses liens avec l’informatique.

Mots clés : biologie systémique, systématique phylogénétique, identification taxonomique, taxon, base de données scientifiques, clique, fuscia

Date : 12-03-2010

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Évolution et phylogénie

Description : Comprendre l’évolution des organismes vivants reste un enjeu majeur de la biologie. L’étude de la transmission de l’information génétique bénéficie des apports de la théorie de l’information.

Mots clés : évolution des organismes vivants, information génétique, mutation, interdisciplinarité, arbre phylogénétique, transfert horizontal, biologie systémique, fuscia

Date : 18-02-2010

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Évolution et phylogénie

Ancêtre commun et cladogramme

Ancêtre commun et cladogramme

Description : Problème de la représentation dans un cladogramme : position des ancêtres communs et des innovations évolutives, proximité entre espèces (groupes).

Mots clés : ancêtre commun, cladogramme, arbre phylogénétique, phylogenèse, caractère dérivé, autapomorphie, synapomorphie, innovation évolutive, groupe monophylétique, clade, groupe paraphylétique

Date : 15-07-2002

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Quand la paléontologie revoit ses données

Quand la paléontologie revoit ses données

Description : Analyses de grandes bases de données de fossiles à l'aide d'outils mathématiques, statistiques et informatiques récents. Deux articles de l'été 2008 conduisent à réviser des conclusions et des idées plus anciennes : ils rappellent ainsi combien les progrès des sciences historiques comme la paléo ...

Mots clés : paléontologie, fossile, base de données, paléoclimatologie, classification, biodiversité, paléo-biodiversité, taxon, clade, phylogénétique, Dinosauriens, super-arbre, paléogéographie

Date : 02-10-2008

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La notion d'évolution

Description : « Rien n'a de sens en biologie si ce n'est à la lumière de l'évolution ». Cet adage célèbre de Th Dobzhansky prend encore plus de valeur quand on se rend compte à quel point la notion d'évolution a été difficile à faire émerger. En effet, au 18ème siècle, de nombreuses idées fausses, comme le créati ...

Mots clés : évolution, théorie synthétique de l'évolution, systématique, phylogénétique, cladistique, selection naturelle, Lamarck, darwinisme, Darwin, biologie animale, génétique des populations, transformisme

Date : 07-07-2002

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La notion d'évolution

Végétaux : diversité, hybridation

Végétaux : diversité, hybridation

Description : En 1998, le Groupe sur la Phylogénie des Angiospermes (APG) publie une étude phylogénétique des plantes à fleurs en comparant des séquences de l'ADN chloroplastique. Ces taxonomistes moléculaires ne retiennent que les groupes strictement monophylétiques (c'est-à-dire descendant tous d'un ancêtre ...

Mots clés : évolution, taxonomie moléculaire, plante à fleur, hybridation, diversité végétale, classification phylogénétique, botanique, coévolution, phylogénie, gène, transgène

Date : 15-07-2002

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L’informatique dans les sciences de la vie

L’informatique dans les sciences de la vie

Description : Dans cet exposé François Rechenmann propose un rapide survol des méthodes algorithmiques utilisées au niveau de l'analyse du génome. On y découvre que l'informatique est à la fois un outil incontournable, puisque seules des méthodes algorithmiques automatiques issus de travaux sur le traitement ...

Mots clés : biologie, dynamique des populations, bioinformatique, alignement de séquences, analyse statistique, système dynamique, phylogénétique, représentation des données, algorithmique, simulation, génome, évolution, région codante

Date : 10-06-2009

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5.3. Remplir un tableau de distances

5.3. Remplir un tableau de distances

Description : Pour tenter de construire l'arbre phylogénétique d'un ensemble d'espèces, nous allons utiliser les données et génotypique ou des données génotypiques disponibles sur ces espèces. Plus clairement, nous allons utiliser des séquences d'un gène homologue de ces espèces. La première étape va consister ...

Mots clés : génomique, algorithmique, bioinformatique, biologie cellulaire et moléculaire, modélisation, arbre phylogénétique

Date : 01-06-2015

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