109 résultats : biologie cellulaire

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Canal-U
2.2. Les gènes, de Mendel à la biologie moléculaire
Description : La séquence de caractères est un bon modèle de l'ADN, un des modèles possibles de l'ADN et il est bon parce qu'il est utile. On va voir en particulier que ce modèle simple peut servir de support à de la prédiction de gènes. On va pouvoir grâce à ce modèle-là, avec les algorithmes appropriés, trouver ...
Mots clés : ADN, génomique, algorithmique, bioinformatique, biologie cellulaire et moléculaire, modélisation
Date : 01-06-2015
Droits : Droits réservés à l'éditeur et aux auteurs. Ces ressources de cours sont, sauf mention contraire, diffusées sous Licence Creative Commons. L’utilisateur doit mentionner le nom de l’auteur, il peut exploiter l’œuvre sauf dans un contexte commercial et il ne peut apporter de modifications à l’œuvre ...
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2.2. Les gènes, de Mendel à la biologie moléculaire
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Canal-U
2.6. Algorithmes + structures de données = programmes
Description : En écrivant le code de la fonction, qui recherche un triplet dans le tableau qui implémente le code génétique, nous avons terminé et obtenu un algorithme de traduction d'une séquence d'ADN, voire d'ARN, en protéines. Arrêtons-nous quelques instants pour évaluer la qualité de cet algorithme, et en ...
Mots clés : génomique, algorithmique, bioinformatique, biologie cellulaire et moléculaire, modélisation
Date : 01-06-2015
Droits : Droits réservés à l'éditeur et aux auteurs. Ces ressources de cours sont, sauf mention contraire, diffusés sous Licence Creative Commons. L’utilisateur doit mentionner le nom de l’auteur, il peut exploiter l’œuvre sauf dans un contexte commercial et il ne peut apporter de modifications à l’œuvre ...
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2.6. Algorithmes + structures de données = programmes
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Canal-U
2.9. Le séquençage de génomes complets
Description : Les progrès dans les technologies de séquençage ont permis d'aborder le séquençage complet de génome. Là encore, les progrès ont été spectaculaires. Prenons l'exemple du projet de séquençage de la bactérie Bacillus subtilis. A l'époque, ce projet s'est étalé de 1989 à 1998. Il a impliqué 35 labo ...
Mots clés : ADN, génomique, algorithmique, bioinformatique, biologie cellulaire et moléculaire, modélisation
Date : 01-06-2015
Droits : Droits réservés à l'éditeur et aux auteurs. Ces ressources de cours sont, sauf mention contraire, diffusées sous Licence Creative Commons. L’utilisateur doit mentionner le nom de l’auteur, il peut exploiter l’œuvre sauf dans un contexte commercial et il ne peut apporter de modifications à l’œuvre ...
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2.9. Le séquençage de génomes complets
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Canal-U
2.3. Le code génétique
Description : Gènes et protéines, mais qu'est-ce qu'une protéine ? Une protéine, c'est également une molécule qui est constituée d'une succession de ce que l'on appelle les acides aminés. C'est donc une chaîne d'acides aminés qui sont des motifs chimiques élémentaires. Il existe 20 acides aminés distincts. Chacun ...
Mots clés : ADN, génomique, algorithmique, bioinformatique, biologie cellulaire et moléculaire, modélisation
Date : 01-06-2015
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2.3. Le code génétique
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Canal-U
2.4. Un algorithme de traduction
Description : Une protéine, en tant que succession d'acides aminés, peut-être vue comme le résultat d'un processus de traduction d'une chaîne de caractères écrite dans un alphabet de 4 lettres en une autre chaîne de caractères écrite en un l'alphabet de 20 lettres. La correspondance entre ces 2 chaînes, la table ...
Mots clés : génomique, algorithmique, bioinformatique, biologie cellulaire et moléculaire, modélisation
Date : 01-06-2015
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Canal-U
2.5. Implémenter le code génétique
Description : Nous avons écrit le corps de l'algorithme de traduction, et nous avons fractionné la complexité d'écriture de cet algorithme en faisant appel à une fonction qui recherche dans le tableau, qui représente le code génétique, un triplet donné et renvoie l'acide aminé. Nous avons donc obtenu cette première ...
Mots clés : ADN, génomique, algorithmique, bioinformatique, biologie cellulaire et moléculaire, modélisation
Date : 01-06-2015
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2.5. Implémenter le code génétique
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Canal-U
2.7. Les compromis de la conception d’algorithmes
Description : La mise en oeuvre d'une structure de données appropriée permet, nous l'avons vu, d'améliorer les performances d'algorithmes. Nous en avons vu l'exemple sur la recherche d'un triplet dans un tableau de code génétique, quand nous avons ajouté ces tables d'index, nous avons vu que nous avons diminué ...
Mots clés : ADN, génomique, algorithmique, bioinformatique, biologie cellulaire et moléculaire, modélisation
Date : 01-06-2015
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Canal-U
2.8. Les technologies de séquençage de l’ADN
Description : Nous parlons beaucoup dans ce cours de séquences génomiques ou séquences d'ADN, que nous voyons pour des raisons algorithmiques sous forme de chaînes de caractères. Comment ces séquences, ces chaînes de caractères, sont-elles obtenues ? D'une manière très imagée, il s'agit de lire la succession ...
Mots clés : ADN, génomique, algorithmique, bioinformatique, biologie cellulaire et moléculaire, modélisation
Date : 01-06-2015
Droits : Droits réservés à l'éditeur et aux auteurs. Ces ressources de cours sont, sauf mention contraire, diffusées sous Licence Creative Commons. L’utilisateur doit mentionner le nom de l’auteur, il peut exploiter l’œuvre sauf dans un contexte commercial et il ne peut apporter de modifications à l’œuvre ...
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2.8. Les technologies de séquençage de l’ADN
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Canal-U
3.1. Tous les gènes se terminent sur un codon stop
Description : Une fois la séquence d'un génome complet obtenue, débute la phase d'annotation. L'annotation elle-même consiste tout d'abord à rechercher la localisation, c'est-à-dire la position des gènes sur cette séquence. Cette semaine, nous allons nous intéresser à la prédiction des gènes, nous allons étudier ...
Mots clés : génomique, algorithmique, bioinformatique, biologie cellulaire et moléculaire, modélisation
Date : 01-06-2015
Droits : Droits réservés à l'éditeur et aux auteurs. Ces ressources de cours sont, sauf mention contraire, diffusées sous Licence Creative Commons. L’utilisateur doit mentionner le nom de l’auteur, il peut exploiter l’œuvre sauf dans un contexte commercial et il ne peut apporter de modifications à l’œuvre ...
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3.1. Tous les gènes se terminent sur un codon stop
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Canal-U
3.7. Index et arbre des suffixes
Description : Il y a donc deux approches pour améliorer la performance des algorithmes de recherche d'un motif dans une chaîne de caractères. La première approche consiste à pré-traiter le motif. On a vu un exemple de cette approche avec l'algorithme de Boyer-Moore.  La deuxième approche consiste à pré-traiter ...
Mots clés : génomique, algorithmique, bioinformatique, biologie cellulaire et moléculaire, modélisation
Date : 01-06-2015
Droits : Droits réservés à l'éditeur et aux auteurs. Ces ressources de cours sont, sauf mention contraire, diffusées sous Licence Creative Commons. L’utilisateur doit mentionner le nom de l’auteur, il peut exploiter l’œuvre sauf dans un contexte commercial et il ne peut apporter de modifications à l’œuvre ...
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3.7. Index et arbre des suffixes
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